危害天目琼花的害虫有水木坚蚧、柳雪盾蚧和蛴螬。如有水木坚蚧危害,可在若虫盛期喷洒95%蚧螨灵乳剂400倍液或20%速克灭乳油1000倍液进行杀灭。如果有柳雪盾蚧发生,可在若虫孵化期喷洒95%蚧螨灵乳剂400倍液或10%吡虫啉可湿性粉剂2000倍液进行杀灭。如有蛴螬危害,可用50%辛硫磷乳油每亩200至250克,加水10倍喷于25千克至30千克细土上拌匀制成毒土,顺垄条施,随即浅锄,或将该毒土撤于种沟或地面,随即耕翻或混入厩肥中施用;用2%甲基异柳磷粉每亩2千克至3千克拌细土25千克至30千克制成毒土;用3%甲基异柳磷颗粒剂、3%吠哺丹颗粒剂、5%辛硫磷颗粒剂或5%地亚农颗粒剂,每亩2.5千克至3千克处理土壤。
天目琼花的常见病害有煤污病和猝倒病。煤污病多发生于夏季高温高湿期,如果有发生,首先应加强修剪,使植株保持通风透光,同时加强水肥管理,提高植株的抗病能力。然后应及时将刺吸类害虫杀除,防止病害蔓延。还可同时用75%百菌清可湿性颗粒800倍液进行喷雾,每周一次,连续喷洒3至4次可有效控制住病情。猝倒病易在幼苗期发生,繁殖前应对土壤进行彻底消毒,如有发生,可用福美双50%可湿性粉剂500倍液进行喷雾,每周一次,直至病情痊愈可停止喷洒。也可用粉剂直接施用于根际部,用量为每平方米2克,然后用小锄进行浅翻,每周撒施一次,直至病情痊愈。